Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Tigd3Q7TM95 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd3Q7TM95 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd3Q7TM95 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.3 ms