Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd2Q7JJ13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brd2Q7JJ13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd2Q7JJ13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms