Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP1Q6WKZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms