Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak2Q6P9N8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak2Q6P9N8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms