Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B2

Ubald1, UBA-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubald1Q6P3B2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubald1Q6P3B2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubald1Q6P3B2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms