Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1Q6NXH3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms