Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mvb12bQ6KAU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12bQ6KAU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12bQ6KAU4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms