Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fan1Q69ZT1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fan1Q69ZT1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fan1Q69ZT1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms