Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9BQ674R7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms