Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl12Q62401 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl12Q62401 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms