Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcf12Q61286 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf12Q61286 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf12Q61286 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf12Q61286 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf12Q61286 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcf12Q61286 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms