Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp4Q60972 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms