Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp1r1bQ60829 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms