Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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