Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm20Q3UQS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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