Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Washc4Q3UMB9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms