Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed8Q3UHI4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmed8Q3UHI4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmed8Q3UHI4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmed8Q3UHI4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmed8Q3UHI4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms