Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Puf60Q3UEB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Puf60Q3UEB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Puf60Q3UEB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms