Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hace1Q3U0D9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hace1Q3U0D9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms