Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms