Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cd300lgQ1ERP8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd300lgQ1ERP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lgQ1ERP8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lgQ1ERP8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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