Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne7Q0VE82 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms