Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NfiaQ02780 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms