Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gabpb1Q00420 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabpb1Q00420 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms