Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp1P97309 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms