Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng7P62956 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacng7P62956 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacng7P62956 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng7P62956 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng7P62956 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms