Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm3P62311 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm3P62311 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms