Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b6P59708 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b6P59708 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms