Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fermt1P59113 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fermt1P59113 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms