Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp5P56399 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp5P56399 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp5P56399 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms