Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab4aP56371 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.7 ms