Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1P55194 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms