Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23bP54728 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad23bP54728 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms