Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e1P52482 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms