Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl5P50228 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms