Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkn1cP49919 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms