Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd10P28359 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms