Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LynP25911 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LynP25911 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LynP25911 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LynP25911 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LynP25911 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LynP25911 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LynP25911 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LynP25911 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LynP25911 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LynP25911 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LynP25911 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LynP25911 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LynP25911 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LynP25911 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms