Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo2P25801 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms