Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Calb1P12658 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms