Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sub1P11031 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sub1P11031 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms