Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms