Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna5P07349 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms