Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrlP06879 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrlP06879 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrlP06879 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrlP06879 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrlP06879 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrlP06879 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrlP06879 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrlP06879 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrlP06879 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrlP06879 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrlP06879 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrlP06879 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrlP06879 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrlP06879 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrlP06879 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrlP06879 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrlP06879 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrlP06879 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrlP06879 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrlP06879 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrlP06879 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms