Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06330 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06330 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06330 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06330 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06330 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06330 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06330 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06330 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06330 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06330 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06330 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06330 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06330 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06330 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms