Protein–RNA interactions for Protein: P04943

Ig kappa chain V-VI region NQ6-8.3.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04943 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04943 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04943 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04943 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04943 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04943 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04943 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04943 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04943 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04943 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04943 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P04943 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04943 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04943 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04943 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04943 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04943 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04943 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P04943 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04943 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P04943 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04943 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04943 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04943 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04943 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04943 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms