Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01748 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01748 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01748 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01748 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01748 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01748 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01748 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01748 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01748 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01748 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01748 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms