Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01660 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01660 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01660 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01660 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01660 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01660 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01660 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01660 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01660 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01660 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01660 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01660 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01660 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01660 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01660 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01660 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01660 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01660 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01660 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01660 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01660 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01660 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01660 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01660 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms