Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkbO88351 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IkbkbO88351 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms