Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp9aO70228 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms